Inizialmente casolare, acquistato agli inizi del 900 dal capitano di Miceli Giuseppe, uomo molto devoto, che la trasformò in chiesa. Denominata "Maria SS. Della Mercede", in data 8 aprile 1985, fu eretta in Santuario dall'arcivescovo Salvatore Cassisa con le seguenti parole: "Affidiamo al signore risorto questa nostra decisione, frutto della consapevolezza della missione corredentrice e materna di Maria nella salvezza del mondo, premio alla devozione filiare dei fedeli di Giardinello ed espressione di ringraziamento e di gratitudine per i doni di grazia ricevuti".
La chiesa della mercede è stata restaurata nei primi mesi del 2007 oltre al rifacimento delle facciate all'ingresso sono stati posti due fari che illuminano la chiesa nelle ore notturne.